讲到蒋介石，蔡元培言道：“他的专横独裁，实为古今中外罕有，只要看他的政府，一切措施无不出自私心🟁🚋，财政部长辞职时，他可以将一切事务官完全引跑了，他们的薪水非但分文不欠，并且他们临走的时候，还每人发干薪两月，而其他各部人员的薪水都欠几个月，教育部竟积欠几百万。蒋临走的时候，还请了三位军人做省政府主席，他的合作精神及和平诚意，已可见一般♤。”
在报告中，蔡忧心重重，深感“时局艰难，政治🝨🍯尤一🞯🗫无办法📛”，言下不胜唏嘘。
这一通牢骚和议论，可谓如梗在喉，不吐🏆🗷不快，其中涉及的对日外交内幕、🄢宁粤和谈经过、蒋氏二次下野前的部署等细节，非局内之人🍮难以道及。
蔡元培以党国元老和国民党中央监察委员的身份，在一系列事件中，处处与国民党的政治举措唱对台戏，让南京国民党当局一部🖠分主政者极为恼火，遂对蔡元培发出警告以至于恐吓和威胁。
1932年11月，国民党南京市党部对蔡元培、杨杏佛🚀🐔营救陈独秀的做法提出书面警🖦🔵告，指其“为清议所不值”“徇于私情，曲加保护，为反🄚♲🌓动张目”。又于次年2月10日要求解散民权保障同盟，并对蔡元培、宋庆龄提出警告，指责“蔡元培、宋庆龄等擅组民权保障同盟，发表宣言，保障反革命及共.党要犯，实破坏本党威信，逾越中委职权”。
1933年6月18日，民权保障同盟总干事、中国人权运动先驱杨杏佛带着儿子驾车外出，至上海亚尔培路时，设伏的“蓝衣社”几名特务突然从路边冲🎾🖩出，将杨杏佛乱枪杀害。
蔡元培闻讯后即驱车前往现场查看，随后到医院瞻礼杨杏佛遗体，集结同仁商讨善后事宜。同日🛄，他以中研院长的身份致电汪精卫、林森，要求立即“饬属缉凶，以维法纪”。
参加🎍杨杏佛公祭🞞🕓的鲁迅说：“今天蔡先生是去的，他很悲哀。……😬🄝⚉打死杨杏佛，原是对于孙夫人和蔡先生的警告，但他们两人是坚决的。”
杨杏佛的事直接导致了民权保障同盟在无形中解散，但☺这没有阻挡住蔡元培人权事业的脚步🁎🄭。
1933年10月，著名新闻人邹韬奋主🏆🗷编的《生活周刊》因为宣扬民🐋♹主、抗日而被国民党当局🛄查封，蔡元培连发两电要求解禁。
1934年2月，共产党员、国民党的老同志何香凝之婿🚀🐔李少石被抓，蔡元培参与营救，与张静江等设法将其保释。
同年9月，著名史学家范文澜在北平被国民党宪兵逮🞯🗫捕☺，蔡元培即致信给汪精卫，促请其下令释放。
193☋♟5年2月，共.产党的重要领导人瞿秋白被国民党捕获，蔡元培知道国民党对付共产党人的手段，他即在国民党中央干部会议上力为辩护，他说🌖⚭🔤像瞿秋白这样的天才在中国不可多得，绝不能杀。
总之，☋♟抗战全面爆发的前几年，为保护🕉🇯进步人士，蔡元培不避凶险，付出了巨大的努力。